icon hataları genelde www ile ilgilidir. Config.php dosyasındaki
define('HTTP_SERVER', 'http://www.siteadı.com/eticaret/');
yerine
define('HTTP_SERVER', 'http://siteadı.com/eticaret/'); olarak deneyebilirsin.

Ama açıkçası seo linkleri sildiğinde düzeliyor durumunu anlamadım.Tema ile ilgili bir sorun da olabilir.