Hiç kafa karıştırmaya gerek yok. Logo ya da herhangi başka bir dizini gizlemez (url klasör yolu olarak bahsediyorsan tabi).
Bootstrap kullanıyorsun, şablonda hidden classını alan her elementi her şekilde gizler.
bootstrap'ta xs, sm, md ve lg'nin hangi cihazlara hitap ettiğini biliyorsunuzdur, bilmiyorsanız eğer kabaca örnekle hidden-xs yaparsan en düşük tarayıcı boyutunda gizler, hidden-sm yaparsan bi geniş ekranında gizler, hidden-md yaparsan tablet çözünürlüğünde gizler, hidden-lg yaparsan masaüstü görünümünde gizler, sadece hidden yaparsan her şekilde gizler.

edit: gizlerden kastım display:none; yapar.