Kullandıgım kadarıyla alt klasörlerdeki .htacces okumuyor direk ana .htacess vermen gerekiyor.
http://prntscr.com/jjabid
buradan verirsen daha sağlıklı olur birde dikkat etmen gereken .htacess verirsen php oldugu klasöre tam yolunu göstermen gerekiyor.