Hata ib_buffer_pool dan ziyade mysql 5.7 de deprecated olan değişkenlerden dolayı kaynaklandığını düşünüyorum. her değişken my.cnf de yazmayabiliyor, mysql tablolarında tuttuğu değişkenlerde olabilir bu
aşağıdaki komutta şifre yazan yere plesk admin şifrenizi yazıp uyguladıktan sonra tekrar denermisiniz.
mysql_upgrade -uadmin -pşifre