Aslında dosya taşımadan da yapılabilir, şimdi aklıma geldi. Her ihtimale karşı yedek aldıktan sonra mysql ve apache'yi kaldırıp
yum -y remove mysqld
yum -y remove httpd
ardından CWP kurulumu yapın. Dosyalar yerinde olduğundan tek yapmanız gereken panelden site ve DB eklemek olur.