wp-admin tarafındaki son güncellemeler ile yapı değiştiğinden bunu yaşıyor olabilirsiniz.

WP_Posts sınıfı bir hayli değişti son dönemlerde.

Çok fazla kategori ve etiket arşivi mevcutsa db de ya da onayda bekleyen comment'leriniz, objeleri cacheletmeniz gerekiyor.

Memcache hakkında sunucunuza danışmanızı öneririm.