Konuyu çok fazla okuyamadım ama başıma geldiği kadarıyla söyleyeyim kısaca...
Bu olay Reverse Proxy'dir. Yani sizin sitenizde ne var ne yok anlık olarak karşı tarafta görünür. Domain farklı fakat dosyalar birebir aynıdır. Yani bir klonlama sözkonusu değil bu durumlarda bilginiz olsun.
Engellemek için ne yapılacağı hakkında bir bilgi yok çünkü bu siteler cloudflare arkasına IP saklayıp bu işi yapıyorlar. Bu sıralar oldukça yaygınlaştı ve sitenize gerçekten zarar veriyor, şahsen benim baya büyük bir sitem sekteye uğradı bunlar yüzünden. Genelde Ruslar yapıyor.
Reverse proxy hakkında genel bilgileri öğrenmek için tıklayın.