Fark etmez backlinkler de 301 yoluyla geçer.
Sitenizde .htaccess yönlendirmeniz şöyleyse örneğin;

siteadi.com yazsanızda
www.siteadi.com yazsanızda
http://www.siteadi.com yazsanızda
http://siteadi.com yazsanızda

.htaccess yönlendirmeniz

https://www.siteadi.com olarak açıyorsa yukarıdaki tüm sorguları.

Backlink'de o adrese yönlenir.