Ama sadece index değilki. site.com/xxx/a.php site.com/xxx/b.php diye taranmış, bunun düzeltmek için htaccess ten bir düzenleme yapmamız gerekli değil mi



Buldum sonunda. Aynı sorunu yaşayanlar için, dizinden subdomaine yönlendirme htaccess kodu:
RedirectMatch 301 ^/xxx/(.*)$ http://xxx.domain.com/$1