Tek boyutlu liste yerine 2 boyutlu liste şeklinde yapsanız çözülür sorun.
Örnek olarak ilk girdi satırı için;
liste[0][0] = 6220
liste[0][1] = 1
liste[0][2] = asdsads
şeklinde bir atama yapıp ilk olarak liste[0][0] için sıralama yaparsınız. Daha sonra ise
if(liste[i][0] == liste[i+1][1])
kontrolü ile ikinci sütuna göre sıralama yapabilrsiniz kendi içinde.