Geçmiş olsun. Dosyalarınızı 1 defa yedekleyin, düzenledikçe yedeği güncellersiniz. Sql için bir cron oluşturup uzak sunucuya öyle günlük felan değil 3-6 saatlik felan yedek aldırttırın. Sonuçta ticari bir site anlık sql e işlenen veri bile değerli.