webmaster toolsdan sol menüde google dizini > url kaldır aracından yapabilirsiniz.

Dizin olarak kaldırdığınızda o dizindeki alt sayfaların tamamı silinir. yada direk sayfa sayfa silebilirsiniz. günlük 1000 adet kaldırma limiti var.
chrome'da celilcan adlı kullanıcının yazdıgı uzantı / eklenti var. urlleri metin dosyasna kaydetip otomatik olarak kaldırma sağlayabilirsiniz. Dikkat edin boş satır olursa site kaldırma işlemi yapar..

https://www.google.com/webmasters/to...ser=0&siteUrl=