Kaç GB ram bellek yüklü sunucunda.
Sanırım nette bulduğun bir mysql configrasyonu kopyalamışsın bu parametrelerin çogu ile işin yok.

SIKINTILI PARAMETRELERİN
key_buffer_size=6GB

Varsayılan mysql engine olarak innodb yapmışsın ve sanırım tabloların innodb
ama myisam engin parametresini (key_buffer_size=6GB) yapmışsın.
Bunu 300M yap.

innodb_buffer_pool_size = 16G
innodb_buffer_pool_size içinde RAM BELEĞİN X 0.75 olarak ayarla
sunucundanki Ram Miktarı 16GB ise 16*0.75= 12G ayarla.
innodb_buffer_pool_size = 12G


innodb_buffer_pool_instances = 12 ayarla.

join_buffer_size=10M buda yine myisam parametresi ve session bazlı ram tüketir.
Bunuda 2M yapsan yeterli hatta 1M yap.

Daha detaylı bilgi bu linki oku:
https://www.r10.net/server-optimizasy...mizasyonu.html