.net konusunda sorun yaşamak istemiyorsanız Windows kullanmanızı öneririm. Son zamanlarda linux sunucuda .net çalışıldığına dair makaleler okuyorum ama randıman alabilmek için biraz daha zaman geçmesi gerekiyor bence. Eğer .net olması şart sa Windows sunucuda devam ediniz.