değişkene atadıktan sonra echo $degisken['yorumSayisi']; diye yazdırırsan kategoride kaç yorum var bulursun buyur.

SELECT *, count(makale_yorum.id) AS yorumSayisi FROM makale_kategori 
INNER JOIN makale_sayfa ON makale_sayfa.kategori=makale_kategori.id 
INNER JOIN makale_yorum ON makale_sayfa.id=makale_yorum.sid 
GROUP BY makale_kategori.id