dosyalara erişmi htaccessten değil de index.php'den yapsanız daha kolay olur aslında ama illa bu şekilde kullanacaksanız (.*) ile başlayanı üste alırsanız sorun çözülür muhtemelen.

RewriteRule ^(.*)$ urunler.php?link=$1 [QSA,L]
RewriteRule ^markalar/(.*)$ markalar.php?link=$1 [QSA,L]
RewriteRule ^katalog$ katalog.php [L]