MYSQL Server has gone away uyarısı dbnin şiştiğini gösterir çözüm olarak cacheleme yapılabilir. Veya kullandığınız bir eklentide optimizasyon sorunu olabilir. Şu aşamada eklentileri kapatıp açarak debugging yapabilirsiniz hangi eklentiden kaynaklandığını. En kötü ihtimalle de sql saldırı alıyor olabilirsiniz incelemek lazım.