tek bi kod bloğuyla farklı checkboxlara istediklerini şu kod ile yapabilirsin

$(".checkboxClassin[data-target-class]").each(function() {
   $("input." + $(this).data("targetClass")).prop("checked",$(this).prop("checked"));
});

Adım adım ne yaptım anlatayim. Şimdi üst taraftaki tüm checkboxlara stil vermek için class kullandığını düşünürek yazdım. ilk satır senin tüm checkboxlarını gezmeni sağlıyor tabi burda dikkat etmen gereken şey üst taraftaki tıklayınca alttakileri seçecek olan checkboxlara özel bir class vermen alttakilerle aynı olmasın yoksa kod onlar içinde çalışır jQuery den html nesnelerine tek tek bir data kaydedebilirsin buda data-*** attribute ile olur yani anlatmak istediğim checkbox şu şekilde

<input type="checkbox" class="checkboxClassi" data-target-class="birinciSecenek" />

Şimdi neden böyle yaptık ne işe yaracak diyorsan. Üst formadaki 1. checkboxa tıklanınca diğer formtaki tüm 1. checkboxları çekmek istiyorsun değil mi ? Eğer istediğin bu ise seçmesini istediğin checkboxların hespine "birinciSecenek" classını ekleyeceksin aynı şekilde üst formda ikince checkboxa data-target-class="ikinciSecenek" attributeunu eklersen alttaki formlarda ikinci checkboxlara "ikinciSecenek" classını ekleyeceksin. Yukarıdaki jQuery kodunda 2. satır ise belirttiğin targetClasstaki inputların checked durumunu üstteki formda yani tıkladığın checkboxlarla aynı yapmaya yarıyor