Sorunu çözdüm. Yazayımda ileride bakan merak edenler olur google dan görürler

arkadaşlar sorun da aslında libx64 kütüphanesinden kaynaklanıyor. ffmpegin centosa net bir desteği yok ubuntu vs gibi dağıtımlara var fakat centos için saçma sapan repolardan kurdugumuz için dosyalarda eksik olma ihtimali var. farklı bir yöntemle yaptım aynı işi. fakat libx264 kütüphanesi gibi hızlı ve stabil çalışan kütüphane olmadgndan sırf bu yuzden ubuntu kurmayı düşünmedim değil.
Neyse sadede geleyim.Vcodec kütüphanesini kullanıyoruz buyrun örnek kod aşağıda.
exec("ffmpeg -framerate 1/5 -i 'videos/image%02d.jpg' -vcodec mpeg4 'videos/out.mp4'");