Aynı durum benim bazı sitelerde de vardı ana sayfaya alınan aşırı backlinklerden kaynaklanıyor genelde eski domainin ana sayfasına çok link kastıysanız 301 atınca bunlar yeni domaine geçince sorun yaratıyor hele birde eski sitenin ve yeni sitenin ipleri farklıysa. Birde sitmapınızı kontrol etmenizi öneririm içeriklerinizi %20 ana sayfanız %100 yapabilirsiniz. Ben 2 ay uğraştım eski linklerimi kategorilere çektim yazılara tanıtım aldım oyle aştım ama 301 atınca tekrar gelebiliyor.