Sitenin kodlarında sitenin açıldığı tarayıcıyı algılayıp mobil uygulamadan girilip girilmediğini sorgulayabilirsiniz ona göre adsense reklamlarını gösterebilirsin. Mobil uygulamada açıldıysa admob kodlarını yerleştirebileceğin appmakr.com'da ilgili eklenti/modül varmı bilmiyorum ama büyük ihtimal vardır. O şekilde mümkün. Yoksa da cordova ile bu mümkün. Bence appmakr yerine cordova platformunu kullanın

edit: bu arada google adsense hesabı varsa admob hesabı da otomatik oluyor diye biliyorum.