Eğer innodb kullanmıyorsanız default storage myisam yaparsanız duracaktır.Eger innodb var ise ibdata loglarında neyden kaynaklı hata olduguna bakıp düzeltmeniz gerekiyor.

Belki çözüm olur bu kodu bir çalıştırın

mysqlcheck --auto-repair --optimize --all-databases