Muhtemelen Apache kullanıyorsunuz ve mysql optimizasyonunuz yapılı durumda değil.
Bu sebepten saldırı anında ram kullanımınız gittikçe artıyor ve sınıra dayanıyor. Yetersiz ram durumunda ise genel olarak ilk down duruma düşen mysql oluyor.
Aynen godaddy hosttaki siteye de saldırdım işlemciden ziyade direkt olarak ram tavan yaptı sanırım bu sizin bu konuda paylaşımlarınızla alakasız o zaman
edit:
sanırım şurayı incelemem işime yarayacak gibi