Selamlar,
Window scroll event'ini takip ederek, elementin top-offset'i ile kıyaslayan bir fonksiyon yazarak yapabilirsiniz.

Alıntı
$(window).scroll(function (event) {
var st = $(this).scrollTop();
if (st > 300) {
$('.element').remove();
}
}
gibi..
Duruma göre 300 yazdığım yerde ilgili elementin offset().top değerini,
remove yazdığım yerde de elemente ne yapmak istiyorsanız onu kullanabilirsiniz.
fonksiyon üzerindeki event değerini de debug ederseniz, üzerindeki property'leri görebilirsiniz