siz css üzerinden sabit bir yükseklik tanımlamazsanız zaten her kutu içeriği boyunca otomatik height alacaktır, ama yapmak istediğiniz farklı birşeyse aşağıda jquery ile yükseklik çeken 4 adet fonksiyon işinize yarayabilir.

.height() - padding border margin hariç yüksekliği getirir.

.innerHeight() - padding dahil, border ve margin hariç yükseklik

.outerHeight() -margin hariç yükseklik

.outerHeight(true) - margin dahil toplam yükseklik

Örneğin:
var kutu_height = $('.kutu').height();

diyerek kutu yüksekliğini alabilir

$('.element').css('height', kutu_height);

koduylada istediğiniz elemente yükseklik atayabilirsiniz.

Ama amacınız kaymayı engellemek ise bu çözümünde kaymayı engelleyeceğini sanmıyorum.

Sabit yükseklik işinizi görmüyorsa kutuları listeleyen döngünüzün html yapısını şu şekilde değiştirerek bir çözüm üretebilirsiniz.

<div class="kutu_row">
  <div class="kutu"></div>
  <div class="kutu"></div>

  <div class="clear"></div>
</div>

<div class="clear"></div>

<div class="kutu_row">
  <div class="kutu"></div>
  <div class="kutu"></div>
  
  <div class="clear"></div>
</div>

Yani her satırı bir div içine alıp araya clear atarsanız kutuların biri büyük biri küçük olsa bile kayan kutu üst satırı etkilemeyecektir.