ben çoğu yedekleme yönteminin riskli olduğunu düşünüyorum en güzeli manuel şekilde mysql dumper ile yedek almak.

http://www.mysqldumper.net/

/yedek diye bir klasör oluşturun buraya kurun scripti, yedek alacağınız database'i buraya bağlayın.

sonra cpanelden bu klasörü şifreleyin ki sizden başkası erişemesin.

yedeklerinizi kendiniz alın mysqldumper sayesinde çok sorunsuz yedek alabiliyorsunuz. otomatik yedek alma sistemlerini sağlıklı bulmuyorum genelde bozuk çıkıyor.