jQuery ile yapılabilir...
Sizin için küçük bir örnek hazırladım... Geliştirebilirsiniz...

Kodları aşağıda ve çalışan demosu buradadır...

<div class="sayilar2">
 <input id="bkutu1" type="text" disabled class="kutu2" value=""/>
 <input id="bkutu2" type="text" disabled class="kutu2" value=""/>
 <input id="bkutu3" type="text" disabled class="kutu2" value=""/>
 <input id="bkutu4" type="text" disabled class="kutu2" value=""/>
 <input id="bkutu5" type="text" disabled class="kutu2" value=""/>
</div>


<div class="sayilar" style="display:none;">
 <input id="kutu1" type="text" class="kutu" value=""/>
 <input id="kutu2" type="text" class="kutu" value=""/>
 <input id="kutu3" type="text" class="kutu" value=""/>
 <input id="kutu4" type="text" class="kutu" value=""/>
 <input id="kutu5" type="text" class="kutu" value=""/>
</div>

<div style="display:none;" class="kontrol">Kontrol</div>




<div class="buton">Sayıları Üret</div>

.buton{
  color:#eee;
  background:#444;
  font-family:arial;
  display:inline-block;
  padding:6px 10px;
  font-size:140%;
  text-align:center;
   
  cursor:pointer;
  clear:both;
  float:left;
 
}

.kontrol{
  color:#eee;
  background:#154621;
  font-family:arial;
  display:inline-block;
  padding:6px 10px;
  font-size:140%;
  text-align:center;
  margin:3px auto;
  cursor:pointer;
   margin-left:10px;
  border-radius:5px;
}
.sayilar{
  margin-bottom:20px;
  display:inline-block;
  float:left;
}

.sayilar2{
  margin-bottom:20px;
  
}
.kutu{
  padding:6px 10px;
  outline:none;
  width:40px;
  border-radius:4px;
  border:3px solid #666;
  text-align:center;
  font-weight:600;
  color:#666;
  font-size:150%;
  
}

.kutu2{
  padding:6px 10px;
  outline:none;
  width:40px;
  border-radius:4px;
  border:3px solid #fff;
  text-align:center;
  font-weight:600;
  color:#666;
  font-size:150%;
  
}

$(".buton").on("click", function() {
  var sayi1 = Math.floor(Math.random() * 100) + 1;
  var sayi2 = Math.floor(Math.random() * 100) + 1;
  var sayi3 = Math.floor(Math.random() * 100) + 1;
  var sayi4 = Math.floor(Math.random() * 100) + 1;
  var sayi5 = Math.floor(Math.random() * 100) + 1;
 
  // aynı sayıların gelmesini engelleyelim
  if(sayi1==sayi2){
    var sayi1 = Math.floor(Math.random() * 100) + 1;
  }
  
  if(sayi1==sayi3){
    var sayi1 = Math.floor(Math.random() * 100) + 1;
  }
  
  if(sayi1==sayi4){
    var sayi1 = Math.floor(Math.random() * 100) + 1;
  }
    
  if(sayi1==sayi5){
    var sayi1 = Math.floor(Math.random() * 100) + 1;
  }
  
  if(sayi2==sayi3){
    var sayi2 = Math.floor(Math.random() * 100) + 1;
  }
  
  if(sayi2==sayi4){
    var sayi2 = Math.floor(Math.random() * 100) + 1;
  }
  
  if(sayi2==sayi5){
    var sayi2 = Math.floor(Math.random() * 100) + 1;
  }
  
  if(sayi3==sayi4){
    var sayi3 = Math.floor(Math.random() * 100) + 1;
  }
  
  if(sayi3==sayi5){
    var sayi3 = Math.floor(Math.random() * 100) + 1;
  }
  
  if(sayi4==sayi5){
    var sayi4 = Math.floor(Math.random() * 100) + 1;
  }
  
  
  $("#bkutu1").val(sayi1);
  $("#bkutu2").val(sayi2);
  $("#bkutu3").val(sayi3);
  $("#bkutu4").val(sayi4);
  $("#bkutu5").val(sayi5);
 
  $(".sayilar").show();
  $(".kontrol").show();
  
});


$(".kontrol").on("click",function(){
  var c1 = $("#bkutu1").val();
  var c2 = $("#bkutu2").val();
  var c3 = $("#bkutu3").val();
  var c4 = $("#bkutu4").val();
  var c5 = $("#bkutu5").val();
  
  var s1 = $("#kutu1").val();
  var s2 = $("#kutu2").val();
  var s3 = $("#kutu3").val();
  var s4 = $("#kutu4").val();
  var s5 = $("#kutu5").val();
  
  if(s1 == "" || s2 == "" || s3 == "" || s4 == "" || s5 == ""){
    alert("Kutuları eksiksiz doldurunuz...");
  }  else {
    
     var s1 = $("#kutu1").val();
  var s2 = $("#kutu2").val();
  var s3 = $("#kutu3").val();
  var s4 = $("#kutu4").val();
  var s5 = $("#kutu5").val();
  
    if(s1>s2 &&
       s1>s3 &&
       s1>s4 &&
       s1>s5 &&
       s2>s3 && 
       s2>s4 &&
       s2>s5 && 
       s3>s4 && 
       s3>s5 && 
       s4>s5){
      alert("Tamamdır büyükten küçüğe sıraladın...");
    } else {
      alert("Hayır sıralama yanlış....");
      
    }
    
    
  }
  
});