index.php de şu döngü kodundan:

<?php if ( have_posts() ) : while ( have_posts() ) : the_post(); ?>

hemen önce şu satırı ekle:

<?php query_posts('cat=-CategoryId'); ?>

Birden fazla kategoriyi gizlemek istiyorsan aralarında virgül koyarak ayır. Örnek:

<?php query_posts('cat=-CategoryId,-CategoryId'); ?>