Başvuruyu TPE'ye yapacaksınız:
http://online.turkpatent.gov.tr/web/index.html


Ancak patent başvuruları marka başvurularından daha karışıktır ve özellikle yazılım algoritması söz konusu olduğunda işler daha da zorlaşabilir, o yüzden kendinizin başvurmasını pek önermem bu konuda uzmanlaşmış bir danışma şirketinden profesyonel yardım almanız daha isabetli olabilir.

Kaynak : http://www.turkhukuksitesi.com/showthread.php?t=87671