Bootstrap bir CSS kod çatısı olduğundan ve CSS istemci tarafından çalıştırılan bir betik olduğundan güvenlik zaafiyeti yaratacak bir durumu olmaz.

PHP'de ise, sınırlı betikler için dikkat edilmesi gereken güvenlik tehditleri SQL Injection, CSRF, XSS gibi saldırılar oluyor. Daha fazla araştırmak lazım...

http://lmgtfy.com/?q=php+güvenlik