<?php
   $isim    = $_POST['isimler'];
   $explode = explode(",",$isim);

			  foreach( $explode as $e )
			  {
				  $ekle = mysql_query("INSERT INTO isim(isim) values('{$e}')");
			  }
?>

İlk yazdığım kodda hata görünmüyor. Normal çalışması lazım. Yukarıdaki kodu deneyin yine boş geliyorsa sorun gelen değerde olabilir.