Html kısmında file input isminin sonuna "[]" ekleyin. Veriler phpye dizi olarak gider.

<input type="file" name="dosya[]" />
<input type="file" name="dosya[]" />
<input type="file" name="dosya[]" />

Php kısmında for döngüsü kullanarak dizi şeklinde gelen bilgileri alın.

for( $f=0; $f<COUNT($_FILES['dosya']); $f++ )
{
	// Upload kodları $_FILES[$f]['name'];
	// Her resim için uygulanacak işlemler
}