yükleyeceğin yere ftp kullanıcı ve şifresi oluşturup yüklemek istediğin sunucuya php ile ftp bağlantı yapıp yükleyebilirsin.
http://php.net/manual/tr/book.ftp.php

Bende günlerce cevap aaradim doğru olani bulamadık. Sonra şunu fark ettik. PHP ile FTP upload yazın. O işlevi scripte yada dosyada çalıştırmak için FTP k.adı vs giriyorsunuz. FTP adresine upload yapacağınız sunucuyu girin. Diğer bilgileri de ayarlayip deneyin.