<?php
$input = array("1.png", "2.png", "3.png");
$rand_keys = array_rand($input, 3);
?>

<div class="bannerler">
<a href="#"><img src="<?php echo $input[$rand_keys[0]]; ?>"></a>
<a href="#"><img src="<?php echo $input[$rand_keys[1]]; ?>"></a>
<a href="#"><img src="<?php echo $input[$rand_keys[2]]; ?>"></a>
</div>