Çözüm 1
-----------
sudo -u mysql mysqld --skip-innodb --default-storage-engine=myisam

Bu komut sonrasında tekrar restart edin bakalım olacak mı?

Çözüm 2
--------------
my.cnf dosyanı nano ile açıp şu kodları yapıştır.

[mysqld] 
innodb=OFF 
ignore-builtin-innodb 
skip-innodb
default-storage-engine=myisam 
default-tmp-storage-engine=myisam

Çözüm 3
--------------
cd /var/lib/mysql
Yukarıdaki dizine girip
rm /var/lib/mysql/ib_logfile0
rm /var/lib/mysql/ib_logfile1
bu komutlar ile ilgili log dosyalarını silin ve tekrar deneyin.

Bunlardan biri mutlaka işe yarar diye düşünüyorum.