CKeditor'un kendi filebrowser apisini kullanabilirsin.
Browse server butonuna tıklandığında senin belirlediğin sayfanın popup'ı açılır ve sen de göstermek istediğin dosyaları gösterebilirsin. (bir projemde yapmıştım fakat uzun zaman önceydi, bulabilirsem paylaşırım)

http://docs.ckeditor.com/#!/guide/dev_file_browser_api
http://docs.ckeditor.com/#!/guide/de..._browse_upload
http://www.mikesdotnetting.com/artic...-net-web-pages
http://devture.com/projects/ckeditor-imagebrowser/demo/
http://www.mixedwaves.com/2010/02/in...r-in-ckeditor/