python ve bash kullanarak ufak bir script yapmıştım belki işinize yarar. tüm mysql tablolarını ve /var/www dizinini zipleyip mega.co.nz ye upload ediyor. backup.sh dosyasını crona bağlarsanız günlük olarak yedekleyebilirsiniz.
http://www17.zippyshare.com/v/a1lZTFzj/file.html