Yazdığınız sorgu biraz hatalı olmuş. Tablo adınız "user", primary key'iniz "id" ve email adresini tuttuğunuz sütunun adı "email" olduğunu tahmin ederek şu şekilde olacağını düşünüyorum;
DELETE u1 FROM user u1, user u2 WHERE u1.id < u2.id AND u1.email = u2.email
Hocam tekrar merhaba

vaktiniz varsa size bir konuda danışmak istiyorum. Site ilk kurulduğu zaman kullanıcılar mail adreslerinin başına "www." koymuş yaklaşık 630 kişi var mail adreslerinden sadece "www."'yı silebilir miyiz sorgu ile? Teşekkür ederim.