Hocam tam olarak anlayabilmek için;
1-) Yönetim paneli cPanel mi?
Eğer ki cPanel ise tarayıcıdada zenmate veya browsec gibi ip değiştiren programdan dolayı sistem otomatik logout işlemi yapar.

Birde config dostyasına ;

ini_set("session.gc_maxlifetime", "28800");
ini_set('session.gc_probability',1);
ini_set('session.gc_divisor',1);
ini_set('session.cookie_lifetime','28800');  
session_set_cookie_params(86400);

şeklinde yazarak deneyin. Sonra problem hala çözülmezse

ini_set('display_errors',1);  error_reporting(E_ALL);
ini_set('error_reporting', E_ALL);

şeklinde confige ekleyerek problem varsa ekrana yazdırın. Muhtemelen ilk adımda problem çözülecektir.

İyi Çalışmalar.