arkadaşım ilginç bir sorun. her şey elimin altında olmadığı için net bir şey söyleyemiyorum. aklıma gelen çözüm yolları:

* site www.siteadi.com olarak eklenmişse siteadi.com olarak ekleyip kontrol edin birde.
* site sahipliğini değiştirin. başka bir hesabı sahibi yapın. tekrar bir kontrol edin.

ancak anladığım kadarıyla sitenizin ziyaretçi sayılarında bir problem yok. sadece siz webmaster tools da göremiyorsunuz. linkler siliniyor olabilir, google orada sadece ciddiye aldığı linkleri listeliyor olabilir, belli bir süre varolan linkleri göstermiyor olabilir. zaten hepsini göstermiyorda net bir şey söylemek zor gerçekten.