textarea içine verileri yazdırırken yani mysql_fetch_array|assoc ne kullanıyorsanız orada
$i=0;
while($row = mysql_fetch_assoc($sql)){
$sira[$i] = $row['id'];
//..... işlemleriniz
$i++;
}

yaparak bir sira array'i tanımlayın ve o array'i oluşan textarea'da düzenleme yaptıktan sonra post ederken gönderin. işlem yapacağınız sayfada post olan textarea'yı \n 'lerden explode edip satır başına $sira id'lerini referans alarak update ettirin.

bu okul ödevi gibi bir soru olmuş. neden böyle uzun bir yol ile güncelleme yapmayı deniyorsunuz anlayamadım ben de bazen inat ederim inat ettiğinizi varsayarak aklıma gelen kolay bi algoritmayı paylaştım umarım faydası dokunur.