Yazılım ile halledilebilir. Yeni apiye biraz baktım ve uğraştırıcı bir süreç.
http://www.tweetdelete.net/ şu gözüme çarptı. Eğer her şeyi silecekseniz buradan twitter ile login olmanızın bi sakıncası olacağını sanmıyorum. zaten her şeyi gözden çıkartmışsınız

eğer api1.1'e göre kendilerini güncelledilerse işe yarıyor olabilir. denediğinizde paylaşırsanız belki ihtiyacı olan arkadaşlar da değerlendirir.
Bu işlemi yaptıktan sonra twitter şifrenizi değiştirerek oraya verdiğiniz yetkiyi sıfırlayabilirsiniz. Eğer güvenmiyorsanız..
yazılım tarafında halletmek için de ;
request uri :
https://api.twitter.com/1.1/statuses/user_timeline.json
query : cursor=-1&screen_name=bluexpres&screen_name=bluexpres
ve tabi oauth ile timeline alınarak tüm id'ler çekilir. Bazı limitler var
https://dev.twitter.com/docs/api/1.1.../user_timeline şuradan bakabilirsiniz.
gelen id'ler de
https://dev.twitter.com/docs/api/1.1.../destroy/%3Aid destroy ile silinebilir.
ilgilenen varsa yardımcı olacağını umuyorum