Buraya bakmanızı tavsiye ederim.

Ayrıca buradan kısaca özetlemek gerekirse:
Sunucularda time-out süreleri vardır genellikle varsayılan değeleri: 30 saniyedir. İlgili sayfa 30 saniye kadar işlem yapar ve bu işlemi bitiremezse time-out verir. Bu durumu canlı seyredebilmeniz ya farklı algoritmalar yaparak adım adım gitmelisiniz (örneğin, işlemleri bölebilirsiniz) ya da varsayılan timeout değerini güncellemelisiniz.

2. yöntem için kendi vps 'iniz varsa yukarıda linkini paylaştığım makale işinize yarayacaktır. Eğer hosting kullanıcısı iseniz, hosting sağlayıcınızla iletişime geçmelisiniz.

Ayrıca .htaccess ya da php settime gibi çözümler bir çok sunucuda işe yaramaz çünkü sunucu içerisindeki timeout değeri buna engel olur. Tabiricaizse kapı içerden kilitli diyebiliriz.

İyi çalışmalar.