siteadi.com/ci/bla şeklinde çalışır ancak siteadi.com/bla yazınca çalışmaz tabikide.
Codeigniter "ci" klasöründe ise ancak o klasörde çalışır. Tüm dosyaları "ci" klasörüne atıp ana dizinde çalışmasını istiyorsan codeigniter anadizinindeki index.php dosyasına "ci" dizinini belirtip sitenin anadizinine at.