Öncelikle indexleri webmaster toolstan silmeyin.Bu yöntemin iyi olmadığını yerli yabancı birçok yerde okudum.
Siz yeni sitenizi kurun diğer indexler birkaç ay içinde kendiliğinden silinecektir zaten.

İlla silcem derseniz webmaster tools url kaldırmada site adresini yazınca tüm sayfaları silmeye alıyor.Tabi bunun için robots'ta disallow satırını eklemeniz gerek. Herşey silindikten sonra robots'U ESKİ HALİNE GETİRMEYİ UNUTMAAYIN.

Ancak dediğim gibi kendi haline bıraksanız zaten 1-2 aya silinir.