Bununla ilgili kısa bir araştırma yaptım, genel kanı şu ; CDN kaynağını Microsoft veya Google'dan alan bir js dosyası üzerinden jquery olayını yaparsan zararı olmayacağını söylüyorlar.

Hiç bir zararı olmaz. Basit bir JS dosyasıdır ve JS dosyaları Google Bot'larda çalışmaz.
Yani preloadı botlar görmez, direkt içeriği görürler.