Arkadaşların dedigi gibi timeout ayarını yapın ve ayarı yaptıktan sonrada aynı sorunu yaşıyorsanız bir tür ddos engelleme ile karşı karşıyasınız.
Sisteminizde inetbase gibi bir yazılım yada portlarınızda (ftp portuda dahil) trafik limitlemesi var ise yine aynı sorunu yaşatacaktır. Sunucuya root erişiminiz varsa "service iptables stop" yazıp dosya aktarımınızdan sonra tekrar "service iptables start" yapabirsiniz. Yada varsa kullandığınız ddos yazılımına kendi IP'nizi white list olarak tanımlayın. Bazı yazılımlarda bu ignore list olarakda geçmektedir.