Dediğiniz gibi her alanda uzman olmak imkansız gibidir onun yerinde bir alanda uzman olup aranılan kişi olmak en mantıklısı yoksa ortalarda kaybolup gidersiniz. Gitmek istediğiniz üniversitenin ders programlarını araştırın (bilg vs yazılım). Karşılaştırmadan sonra daha net karar verebilirsiniz. Bilgisayar mühendisliğinin alanı yazılıma göre daha geniş olduğu için dediğiniz gibi biraz bilgisayar yazılımı kapsar durumu var üniversitede. Fakat kararınız kesin yazılım üzerine gitmekse boşuna donanım dersleri vs alıp vakit kaybetmenin de anlamı olmadığını düşünüyorum.
Bölüm hakkındaki düşüncelerim bunlar üniversiteler hakkında ise bilgim yok fakat o konudaki tek önerim yeni açılan bölümü iyice araştırmanız ve tercih yaparken açıkta kalmamak için kendinizi sağlama almanız.
Şimdiden başarılar ileriki eğitim hayatınızda.