Tam anlamadım ama
tek site birden çok database istiyorsan
üye adı kısmına hangi databaseye erişeceğini kodla
örnek
itu_user
otdu_user
eğer itu ile başlarsa
sql bağlantısını
itu datebaseye yap
otdu ile başlıyorsa otdu datebase yap
tüm site aynı veri tabanları farklı olur
hatta girişleride böyle yapabilirsin
sinavsistemi.com/ogrenci
sinavsistemi.com/oretmen
sinavsistemi.com/mudur
gibi
@crazykurba'nın mantığı diğer önerilere göre iyi gibi.Benimde önerim bunu çoklu veritabanı olarak değilde tek veritabanı içinde tabloların başıda bu ekleri kullansanız da olabilir itu_uyeler,itu_haberler,odtu_uyeler gibi...