sadece webmin kurmuşsanız tüm servislerin (dns - mail - web - mysql vs) conf dosyalarını elle kendiniz düzenlemek zorundasınız, webmin kurduktan sonra virtualmin de kurarsanız otomatik olarak kendisi default ayarları yapar ayrıca istediğiniz yeride System Settings >> Server Templates >> Default Settings kısmından değiştirebilirsiniz.

virtualmin kurmak için aşağıdakileri yapmanız yeterlidir, mevcut yapılandırmanızı silmez ancak mevcut sitelerinizi silip virtualmin üzerinden tekrar açmanızı tavsiye ediyorum.